יש טבעת של אטם איטום עם גמישות טובה על מסגרת פילטר HEPA, שמתאימה מקרוב עם שקע אספקת האוויר היעילה הגבוהה. בתהליך השימוש, אנשי תחזוקה ובנייה מסוימים יעמדו על שקע האוויר. אם הם לא נזהרים, או שהחוזק המבני של מוצא אספקת האוויר היעילה הגבוהה הוא גרוע, ייתכן כי מוצא האוויר מעוות ויהיו פערים בין המסנן למבנה האיטום.
האוויר שלא מסונן על ידי פילטר HEPA נכנס לחדר הנקי מהפער, מה שישפיע על הניקיון. אין לאתר תופעה זו תוך זמן קצר. חשבנו שזו הבעיה של פילטר HEPA, אבל אחרי זמן רב, אבק מוערם סביב הפער. כאשר נמצא כי הניקיון עולה על הסטנדרט, נפתח תחילה את פתח השוואת הזרימה בשקע אספקת האוויר, ונשתמש במכשיר הבדיקה כדי לבדוק אם יש דליפת אוויר. בנוסף, האטמים על כמה מסנני HEPA הם בעלי גמישות טובה וחתך מעגלי חצי רציף ללא מפרקים, הנמצאים במגע בשורה עם הפנים ההרכבה של המסנן, ואילו האטמים במסנני HEPA אחרים הם ארבעה אטמים שטוחים, שנמצאים במגע פנים. איטום מגע בשורה טוב יותר ממגע פני השטח.
כאשר הפילטרים לפני המסננים העדינים בתיבת המזגן פועלים ללא אטמים, קשה לזהות גם אם יש סביבם דליפת אוויר. אם יש יותר מדי דליפת אוויר, עמידות הלחץ ההפרש עשויה לגדול בצורה לא תקינה, אך לא ניתן להגן ביעילות את מסנן ה- HEPA בסוף החדר הנקי המוגן על ידי פילטרים מקדימים אלה, ואת חיי השירות יקצרו.
לפעמים, היעילות של הקדם-פילטר אינה נמוכה, אך חייו של פילטר ה- HEPA המוגן עדיין קצרים. הבעיה טמונה לעתים קרובות באיטום של פילטר הקדם בתיבת המיזוג. למרות שזה לא קפדני כמו פילטר HEPA, הוא חייב להיות אטום. תיבת המזגן תספק מבנה איטום אמין למסנן. צריך להיות אטם איטום עם ביצועים טובים ומנגנון הידוק נוח ואמין. אם אין מנגנון הידוק או שמנגנונים אלה אינם בשימוש רגיל, החזרת האוויר עשויה לפוצץ את המסנן כאשר המזגן מושבת, והמסנן אינו במקום, מה שאומר שאין פרק סינון. באתר, איטום והידוק תקלות של סינון טרום מתרחשות לעתים קרובות, משפיעים על ידי בעיות ציוד, בעיות פילטר או בעיות פעולה.
